Этот проект получил название Структурная база данных аллергенных белков (SDAP). "Мы хотим делать прогнозы об (известных или новых) белках, которые могут быть аллергенами, по (аминокислотной) последовательности или известной трехмерной структуре", - говорит профессор биохимии и генетики человека из Медицинского отделения Университета Техаса Уэрнер Браун (Werner Braun).

По его утверждению, это первая реляционная база данных, классифицирующая и собирающая информацию об аллергенах. Кроме того, по его утверждению, это единственная база данных, в которой доступ к информации об эпитопах аллергенов осуществляется с веб-страницы. Данные для этой базы, как сообщается, были получены из публикаций в научной литературе.

Команда техасских ученых уже использовала базу данных для поиска похожих по строению аллергенов. Например, кедры, растущие в разных странах, относящиеся к разным видам, оказывают похожее влияние на аллергиков, так как структура их эпитопов похожа. То же самое с теми, у кого есть аллергия на креветки. Выяснилось, что аллергия у них может проявляться даже на тараканов и устриц.

Существующие базы данных по аллергенам, как утверждают ученые, могут лишь предоставить их список и не позволяют проводить анализ структуры белков. "Мы стараемся обновлять и поддерживать базу данных, и надеемся, что исследователи будут высылать нам их данные после публикации, так что мы не пропустим аллергены", - добавил профессор Браун.

Рассказ о новых возможностях был представлен на конференции Американского колледжа аллергии, астмы и иммунологии.

Источник: Mednovosti.Ru